電影: V1 Studio

以635米的高度為傲、可以俯瞰東京街景的鈴木塔（Bell Tree Tower）竣工。前往參加其開幕儀式的柯南等人，從眺望台上享受著絕美的景色。就在此時，一發子彈擊碎了窗戶玻璃，打穿了一個男人的胸膛。案件發生於一瞬之間，完全搞不清到底發生了什麼，小蘭與少年偵探團陷入恐慌。柯南立刻利用追蹤眼鏡的望遠鏡功能，沿著彈道發現了一個黑色的身影。「從那麼遠的距離進行狙擊，怎麼可能？！」柯南馬上與女高中生偵探世良真純乘坐摩托車追趕逃走的狙擊手，意想不到的是狙擊手居然連警察的巡邏車都打算一起炸掉，整個追蹤過程都...

正當東京街頭充滿萬聖節氛圍時，澀谷 HIKARIE 正在舉行婚禮，而婚禮現場有著身穿禮服的佐藤刑警。正當柯南一行人在現場觀察著來賓時，現場突然闖進了一名暴徒，而為了保護大家的高木刑警卻因此身陷危機？！雖然後來事件安全落幕，但佐藤卻回想起了 3 年前的連續爆炸案件，而當時殉職的松田刑警恰巧與高木刑警的身影重疊。 與此同時，連續爆炸案件的犯人逃獄了，究竟這一連串的事件純粹是巧合還是另有隱情？公安警察的降谷零 (安室透) 為了前往追捕逃獄的犯人，卻被神秘的偽裝男子戴上了頸圈炸彈。為了將炸彈解除而潛伏...

揭露以往未能公開的懸案：讓柯南、灰原哀縮小的「APTX4869」藥物的秘辛；青春熱血的「少年偵探團」曾調查過的神祕案件；備受關注的人氣角色的行動及想法將陸續曝光。 高中生偵探工藤新一與毛利蘭在熱帶樂園約會時，意外發現行動詭異的黑衣男子——琴酒等人，新一便發揮他的偵探精神獨自跟蹤他們，沒想到竟被灌下神秘毒藥「APTX4869」。 醒來的新一發現自己居然變成小孩子的模樣……。查覺到自己可能捲入危機，他化名為「江戶川柯南」，一邊寄住在小蘭家中，技巧性的利用過氣偵探毛利小五郎偵破許多案件，並一直尋找...

因受邀參加新辦公大樓落成紀念電影《大怪獸哥梅拉VS假面超人》的製作發表會，柯南等人來到大阪的日賣電視台。 製作發表期間，幹練的製作人米倉在倉庫發生意外，遭巨大的怪獸模型壓倒死亡。支撐模型的繩索被人用刀子割斷，隸屬大阪府警的大瀧警官將之視為命案而非意外，嫌犯鎖定為米倉的三名下屬，並展開搜查……...