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由於在現實生活中太過不順，加上空地也無法玩耍，大雄和他的夥伴哆啦A夢、小夫、胖虎和靜香決定進行史上最大規模的離家出走。同時，由於發生時空錯亂，一名名叫古古兒的遠古時代中國人來到20世紀的東京，後被大雄等發現，帶到七萬年前。原來古古兒的光明族被黑暗族侵略，而黑暗族的首領是來自未來世界的巨尊比，他妄圖改變世界歷史，但是在時光巡邏隊的協助下，最後巨尊比的陰謀破產，而古古兒和他的部族來到了日本，成為日本人的始祖。...

暑假的自由研究進行不下去的大雄，用哆啦A夢的秘密道具「創世組件」開闢新的宇宙，觀察地球型行星的歷史。在誕生了人類之中，有個與大雄長相非常像的人。大雄對自己的祖先提供援助，成為那個世界的神秘力量。到了現代後，野比野美秀和出木松，源靜代等向南極進發。並且看到了在地下世界的昆蟲文明。原來，在新的地球里本來應該發展的是昆蟲文明。到底新世界的命運的將何去何從……...

某天夜晚，大雄從一片粉紅色的霧氣里（後來得知是22世紀的任意瓦斯，動物們稱為光之梯）進入一片從未見過的森林，在那裡動物用人的語言交流，而且都是直立行走。次日，大雄將這件事告訴同學，大家笑他是「在發童話世界的夢」。儘管大雄拿了一朵從夢境裡帶來的花，一樣無人相信。同時，開發商有將後山興建成為高爾夫球場的計劃。那個夜晚，大雄再次進入那片森林，原來那不是夢，而是一個動物星球。大雄和哆啦A夢遇到了吉波，並成為好朋友。 次日，打算削平後山的人開始了勘測，儘管哆啦A夢用道具轟走了，但是這些人仍不死心。後來，...

在現實世界諸事不順的大雄，抱怨這個世界沒有魔法。某天他無意間發現自己跟哆啦A夢的石像，正好奇這些石像的來龍去脈時，憧憬魔法的大雄突發奇想使用「如果電話亭」實現夢想，而石像亦隨之消失。可是，變出來的魔法世界並不是大雄的理想國，所以讓大雄感到沮喪。有名的魔法研究者——滿月博士告知大家一個可怕的消息：魔界星不過多久便會完全接近地球。當大雄想變回現實世界，但是幻想電話亭己被媽媽扔掉。滿月博士解讀古文書後被捉走，逃亡的美夜子得大雄等人支持，一起出發至魔界星。 在魔界星經歷了一番大冒險，其中包括魔界的南極...

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羅布魯在超越時空時發生事故，飛船的門與大雄房間的塌塌米連接在一起。從此曠野星成為大雄的第二遊樂場。 大雄與羅布魯們度過了愉快的時光。但是卡爾泰礦業公司為獲得礦藏不斷威脅星球上居民的安全。 最後在大雄與他的夥伴們的幫助下，卡爾泰礦業公司的陰謀被粉碎，而超時光出口也恢復了原狀，大雄回到了地球。...

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